現在、いくつかの奇妙な問題が発生していますRStudioで簡単なMarkdownスクリプトを処理するとき。 Summary()関数は誤った結果を出し、RStudioがエラーをまったく出していないため、何が起こっているのかわかりません。
次のRMarkdownスクリプトを実行した場合(データを含むファイルを配置しました ここに)
```{r}
load("mydata.rda")
summary(mydata$b)
head(sort(mydata$b))
```
```{r}
sessionInfo()
```
私は次の結果を得る
load("mydata.rda")
summary(mydata$b)
## Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
## 0 6000 10000 12000 16000 35000
head(sort(mydata$b))
## [1] -0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00
sessionInfo()
## R version 2.15.1 (2012-06-22)
## Platform: x86_64-apple-darwin9.8.0/x86_64 (64-bit)
##
## locale:
## [1] es_ES.utf-8/es_ES.utf-8/es_ES.utf-8/C/es_ES.utf-8/es_ES.utf-8
##
## attached base packages:
## [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
##
## other attached packages:
## [1] knitr_1.0.5
##
## loaded via a namespace (and not attached):
## [1] digest_0.5.2 evaluate_0.4.3 formatR_0.6 plyr_1.7.1
## [5] stringr_0.6.1 tools_2.15.1
ご覧のとおり、結果は間違っています。なぜなら「b」変数の実際の最小値は負であり、summary()の実行では無視されるようです。 Knitr Rnw pdfスクリプトを使用して同じことを試みましたが、まったく同じです。ただし、Sweaveで実行すると、結果は問題ありません。
knitr / RStudioで呼び出されたときに返されるサマリー関数とは何ですか?これは私が見逃している何かの副作用か、バグですか?
よろしく、 ガス
回答:
回答№1は2ドキュメントの上部に次を追加してみてください。
```{r, echo=FALSE}
options(digits = 7)
```
Rセッションとマークダウン-> HTML knitrセッションの違いを確認するには、Rコンソールに次のように入力し、マークダウンドキュメントに含めて、それぞれの出力を比較します。
options()
options("digits")
デフォルトのRセッションでは7ですが、マークダウンファイルからHTMLドキュメントを作成する環境では(少なくとも私のシステムでは)4です。