Zapisz rysunek ggplot2 poprzez rpy2 w buforze Pythona - python, python-3.x, ggplot2, rpy2

Próbuję zapisać wynik pliku ggplot2 R obiekt utworzony za pomocą rpy2 do bufora kontrolowanego przez Python.

Mogę to zrobić za pomocą matplotlib ale nie mogę tego zrobić ggplot2 przez rpy2.

W matplotlib.pyplot, można to osiągnąć za pomocą:

import matplotlib.pyplot as plt
import io
import numpy

def test_save():
x = numpy.linspace(-5, 5)
y = 3*x + 2
fig = plt.figure()
plt.plot(x, f)
buf = io.BytesIO()
plt.savefig(buf, format = "png")
return buf

ggplot2 próba:

import io
import numpy
import rpy2.robjects as robjects
from pandas import DataFrame
import rpy2.robjects.lib.ggplot2 as ggplot2


def test_ggplot2_save():

x = numpy.linspace(-5, 5)
y = 3*x + 2
df = DataFrame({"x": x, "y": y})

gp = ggplot2.ggplot(df)
pp = (gp
+ ggplot2.aes_string(x="x", y="y")
+ ggplot2.geom_point()
+ ggplot2.labs(title="MY DATA", x="x", y="y"))
# pp.plot()

buf = io.BytesIO()

robjects.r.ggsave(filename=buf, plot=pp, width=200, height=120, unit="mm")

Błąd:

NotImplementedError: Konwersja "py2ri" nie została zdefiniowana dla obiektów typu ""

Próbowałem użyć rpy2.robjects.lib.ggplot2.GGPlot.save cecha.

Odpowiedzi:

R "s ggplot2::ggsave oczekuje argumentu określającego ścieżkę (względną lub bezwzględną) jako argument parametru filename. Na przykład "/this/is/my/figure.png".

Python BytesIO obiekt jest zupełnie inny. Jest to binarny strumień w pamięci (w przybliżeniu obiekt Pythona zachowujący się jak plik (binarny)).

Jeśli używasz ggsave nie jest bezwzględnym wymogiem, rozważ użycie rpy2.robjects.lib.grdevices.render_to_bytesio(). Jest to funkcja, która wyświetla następujące liniowe liczby w notatniku Jupyter:

from rpy2.ipython.ggplot import image_png
# pp is your ggplot2 figure
display(image_png(pp))